Rory Donovan-Maiye

Viittaukset

	Kaikki	2019 lähtien
Sitaatit	479	381
h-indeksi	12	11
i10-indeksi	12	11

120

2007200820092010201120122013201420152016201720182019202020212022202320244 4 1 3 2 1 6 6 18 23 25 44 41 65 92 102 36

Yleisessä käytössä

Näytä kaikki

10 artikkelia

0 artikkelia

käytettävissä

ei käytettävissä

Perustuu rahoitusehtoihin

Muut kirjoittajat

Daniel M. ZuckermanProfessor of Biomedical Engineering. Oregon Health & Science UniversityVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa ohsu.edu
Gregory R. JohnsonNewLimitVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa newlimit.com
Mary M MaleckarSimula Research LaboratoryVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa simula.no
Julie TheriotDepartment of Biology, University of WashingtonVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa uw.edu
AJ SedgewickSenior Computational Systems Biologist, Tempus LabsVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa tempus.com
James R FaederUniversity of PittsburghVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa pitt.edu
Leroy HoodInstitute for Systems BiologyVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa systemsbiology.org
Nathan D. PriceCSO, Thorne HealthTech; Professor, Institute for Systems BiologyVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa systemsbiology.org
Ravi MadduriSenior Scientist, University of Chicago, Argonne National LabVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa uchicago.edu
Theo KnijnenburgAltius Institute for Biomedical SciencesVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa altius.org
Eva Maxfield BrownPhD Student, University of Washington Information SchoolVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa uw.edu
Gwênlyn GlusmanInstitute for Systems BiologyVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa isbscience.org
Panayiotis (Takis) BenosWilliam Bushnell Presidential Chaired ProfessorVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa ufl.edu
Seth A. Ament, Ph.D.University of Maryland School of MedicineVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa som.umaryland.edu
Robert F. MurphyProfessor of Computational Biology Emeritus, Carnegie Mellon UniversityVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa cmu.edu
Jose Juan TapiaData Scientist, Monsanto CompanyVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa pitt.edu
Devin P SullivanEncodia Inc.Vahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa encodia.com
Joan RedwingPenn State UniversityVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa psu.edu
Xiaoxing XiTemple UniversityVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa temple.edu
Ramu AnandakrishnanEdward Via College of Osteopathic MedicineVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa vt.edu

Seuraa

Rory Donovan-Maiye

Novo Nordisk

Vahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa alumni.reed.edu - Kotisivu

Computational Biology Biophysics Machine Learning AI


Nimike Lajittele sitaattien mukaan Lajittele vuoden mukaan Lajittele otsikon mukaan	Viittaukset Viittaukset	Vuosi
Learning mixed graphical models with separate sparsity parameters and stability-based model selection AJ Sedgewick, I Shi, RM Donovan, PV Benos BMC bioinformatics 17, 307-318, 2016	78	2016
Efficient stochastic simulation of chemical kinetics networks using a weighted ensemble of trajectories RM Donovan, AJ Sedgewick, JR Faeder, DM Zuckerman The Journal of chemical physics 139 (11), 2013	61	2013
Integrated intracellular organization and its variations in human iPS cells MP Viana, J Chen, TA Knijnenburg, R Vasan, C Yan, JE Arakaki, M Bailey, ... Nature 613 (7943), 345-354, 2023	50	2023
Building a 3d integrated cell GR Johnson, RM Donovan-Maiye, MM Maleckar BioRxiv, 238378, 2017	48	2017
Unbiased rare event sampling in spatial stochastic systems biology models using a weighted ensemble of trajectories RM Donovan, JJ Tapia, DP Sullivan, JR Faeder, RF Murphy, M Dittrich, ... PLoS computational biology 12 (2), e1004611, 2016	44	2016
Cell states beyond transcriptomics: Integrating structural organization and gene expression in hiPSC-derived cardiomyocytes KA Gerbin, T Grancharova, RM Donovan-Maiye, MC Hendershott, ... Cell Systems 12 (6), 670-687. e10, 2021	39	2021
Atlas of transcription factor binding sites from ENCODE DNase hypersensitivity data across 27 tissue types CC Funk, AM Casella, S Jung, MA Richards, A Rodriguez, P Shannon, ... Cell reports 32 (7), 2020	31	2020
Degradation of MgB/sub 2/thin films in water Y Cui, JE Jones, A Beckley, R Donovan, D Lishego, E Maertz, ... IEEE transactions on applied superconductivity 15 (2), 224-227, 2005	29	2005
A comprehensive analysis of gene expression changes in a high replicate and open-source dataset of differentiating hiPSC-derived cardiomyocytes T Grancharova, KA Gerbin, AB Rosenberg, CM Roco, JE Arakaki, ... Scientific Reports 11 (1), 15845, 2021	26	2021
Biophysical comparison of ATP synthesis mechanisms shows a kinetic advantage for the rotary process R Anandakrishnan, Z Zhang, R Donovan-Maiye, DM Zuckerman Proceedings of the National Academy of Sciences 113 (40), 11220-11225, 2016	22	2016
A deep generative model of 3D single-cell organization RM Donovan-Maiye, JM Brown, CK Chan, L Ding, C Yan, N Gaudreault, ... PLOS Computational Biology 18 (1), e1009155, 2022	19	2022
Robust integrated intracellular organization of the human iPS cell: where, how much, and how variable MP Viana, J Chen, TA Knijnenburg, R Vasan, C Yan, JE Arakaki, M Bailey, ... BioRxiv, 2020.12. 08.415562, 2020	19	2020
BDQC: a general-purpose analytics tool for domain-blind validation of Big Data EW Deutsch, R Kramer, J Ames, A Bauman, DS Campbell, K Chard, ... bioRxiv, 258822, 2018	5	2018
Studying stem cell organization using “label-free” methods and a novel generative adversarial model G Johnson, R Donovan-Maiye, C Ounkomol, MM Maleckar Biophysical Journal 114 (3), 43a, 2018	4	2018
Systematic testing of belief-propagation estimates for absolute free energies in atomistic peptides and proteins RM Donovan-Maiye, CJ Langmead, DM Zuckerman Journal of chemical theory and computation 14 (1), 426-443, 2018	4	2018
O3‐03‐01: MECHANISTIC AND DIRECTIONAL TRANSCRIPTIONAL REGULATORY NETWORKS IN ALZHEIMER'S DISEASE CC Funk, MA Richards, P Shannon, R Donovan-Maiye, N Rappaport, ... Alzheimer's & Dementia 14 (7S_Part_19), P1014-P1015, 2018		2018
A novel conditional model of cell organization: building an integrated cell GR Johnson, R Donovan-Maiye, MM Maleckar, CD Williams INTEGRATIVE AND COMPARATIVE BIOLOGY 58, E109-E109, 2018		2018
Efficient sampling in stochastic biological models R Donovan-Maiye University of Pittsburgh, 2016		2016
Quantization of Constrained Systems RM Donovan Reed College, 2004		2004
Enhancing generative perturbation models with LLM-informed gene embeddings K Märtens, R Donovan-Maiye, J Ferkinghoff-Borg ICLR 2024 Workshop on Machine Learning for Genomics Explorations, 0

Järjestelmä ei voi suorittaa toimenpidettä nyt. Yritä myöhemmin uudelleen.

Artikkelit 1–20

Sitaatteja vuodessa

Päällekkäiset lähteet

Yhdistetyt sitaatit

Lisää muut kirjoittajatMuut kirjoittajat

Seuraa

Viittaukset

Muut kirjoittajat