Todd J. Treangen

Viittaukset

	Kaikki	2016 lähtien
Sitaatit	14820	10689
h-indeksi	25	22
i10-indeksi	29	28

2500

1250

625

1875

200920102011201220132014201520162017201820192020202142 49 84 358 874 1138 1411 1595 1873 1834 2238 2407 733

Yleisessä käytössä

Näytä kaikki

24 artikkelia

2 artikkelia

käytettävissä

ei käytettävissä

Perustuu rahoitusehtoihin

Muut kirjoittajat

Sergey KorenStaff Scientist, NHGRI/NIHVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa nih.gov
Adam M. PhillippySr. Investigator, National Human Genome Research Institute, NIHVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa nih.gov
Mihai PopProfessor of Computer Science, University of Maryland, College ParkVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa umd.edu
Brian OndovNational Human Genome Research InstituteVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa nih.gov
Steven SalzbergBloomberg Distinguished Professor, Johns Hopkins UniversityVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa jhu.edu
Nicholas BergmanSenior Principal Investigator, NBACCVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa nbacc.dhs.gov
Daniel D SommerNational Biodefense Analysis and Countermeasures CenterVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa nbacc.dhs.gov
Eduardo RochaCNRS, Institut PasteurVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa pasteur.fr
Aaron DarlingProfessor of computational (meta)genomics, University of Technology SydneyVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa uts.edu.au
Aleksey V ZiminAssociate Research Scientist, Department of Biomedical Engineering, Johns Hopkins UnviersityVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa jhu.edu
Guillaume MarcaisProject ScientistVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa cs.cmu.edu
James A. YorkeUniversity of MarylandVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa umd.edu
Ryan Leo ElworthPostdoctoral Scientist, Rice UniversityVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa rice.edu
Páll MelstedProfessor of Computer Science, University of IcelandVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa hi.is
Michael C. SchatzBloomberg Distinguished Associate Professor, Johns Hopkins UniversityVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa cs.jhu.edu
Daniela PuiuJohns Hopkins UniversityVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa jhu.edu
Christopher M. HillEngineer at GoogleVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa umd.edu
Daniel SegrèProfessor at Boston University, Biology, Biomedical Engineering, Physics, BioinformaticsVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa bu.edu
Varun MazumdarSeres TherapeuticsVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa serestherapeutics.com
Lina FallerGinkgo BioworksVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa bu.edu

Todd J. Treangen

Assistant Professor, Department of Computer Science, Rice University

Vahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa rice.edu - Kotisivu

Bioinformatics Computational Genomics Metagenomics


Nimike Lajittele sitaattien mukaan Lajittele vuoden mukaan Lajittele otsikon mukaan	Viittaukset Viittaukset	Vuosi
Structure, function and diversity of the healthy human microbiome C Huttenhower, D Gevers, R Knight, S Abubucker, JH Badger, ... nature 486 (7402), 207, 2012	6600	2012
A framework for human microbiome research BA Methé, KE Nelson, M Pop, HH Creasy, MG Giglio, C Huttenhower, ... nature 486 (7402), 215, 2012	1618	2012
Repetitive DNA and next-generation sequencing: computational challenges and solutions TJ Treangen, SL Salzberg Nature Reviews Genetics, 2011	1420	2011
Mash: fast genome and metagenome distance estimation using MinHash BD Ondov, TJ Treangen, P Melsted, AB Mallonee, NH Bergman, S Koren, ... Genome biology 17 (1), 1-14, 2016	957	2016
The Harvest suite for rapid core-genome alignment and visualization of thousands of intraspecific microbial genomes TJ Treangen, BD Ondov, S Koren, AM Phillippy Genome biology 15 (11), 1-15, 2014	831	2014
GAGE: A critical evaluation of genome assemblies and assembly algorithms SL Salzberg, AM Phillippy, A Zimin, D Puiu, T Magoc, S Koren, ... Genome research 22 (3), 557-567, 2012	751	2012
Horizontal transfer, not duplication, drives the expansion of protein families in prokaryotes TJ Treangen, EPC Rocha PLoS Genet 7 (1), e1001284, 2011	428	2011
Deep sequencing of the oral microbiome reveals signatures of periodontal disease B Liu, LL Faller, N Klitgord, V Mazumdar, M Ghodsi, DD Sommer, ... PloS one 7 (6), e37919, 2012	362	2012
Next generation sequence assembly with AMOS TJ Treangen, DD Sommer, FE Angly, S Koren, M Pop Current Protocols in Bioinformatics 33 (1), 11.8. 1-11.8. 18, 2011	209	2011
Accurate and fast estimation of taxonomic profiles from metagenomic shotgun sequences B Liu, T Gibbons, M Ghodsi, T Treangen, M Pop BMC Genomics 12 (Suppl 2), S4, 2011	207	2011
MetAMOS: a modular and open source metagenomic assembly and analysis pipeline TJ Treangen, S Koren, DD Sommer, B Liu, I Astrovskaya, B Ondov, ... Genome Biology 14 (1), R2, 2013	188	2013
A new rhesus macaque assembly and annotation for next-generation sequencing analyses AV Zimin, AS Cornish, MD Maudhoo, RM Gibbs, X Zhang, S Pandey, ... Biology direct 9 (1), 1-15, 2014	146	2014
Bambus 2: scaffolding metagenomes S Koren, TJ Treangen, M Pop Bioinformatics 27 (21), 2964-2971, 2011	146	2011
Genesis, effects and fates of repeats in prokaryotic genomes TJ Treangen, AL Abraham, M Touchon, EPC Rocha FEMS microbiology reviews 33 (3), 539-571, 2009	144	2009
M-GCAT: interactively and efficiently constructing large-scale multiple genome comparison frameworks in closely related species T Treangen, X Messeguer BMC bioinformatics 7 (1), 433, 2006	95	2006
The impact of the neisserial DNA uptake sequences on genome evolution and stability TJ Treangen, OH Ambur, T Tonjum, EPC Rocha Genome biology 9 (3), 1-17, 2008	86	2008
Automated ensemble assembly and validation of microbial genomes S Koren, TJ Treangen, CM Hill, M Pop, AM Phillippy BMC bioinformatics 15 (1), 1-9, 2014	71	2014
Microbiome analysis of a microalgal mass culture growing in municipal wastewater in a prototype OMEGA photobioreactor LT Carney, SS Reinsch, PD Lane, OD Solberg, LS Jansen, KP Williams, ... Algal Research 4, 52-61, 2014	71	2014
Metagenomic assembly through the lens of validation: recent advances in assessing and improving the quality of genomes assembled from metagenomes ND Olson, TJ Treangen, CM Hill, V Cepeda-Espinoza, J Ghurye, S Koren, ... Briefings in bioinformatics 20 (4), 1140-1150, 2019	66	2019
Complete Columbian mammoth mitogenome suggests interbreeding with woolly mammoths J Enk, A Devault, R Debruyne, CE King, T Treangen, D O'Rourke, ... Genome biology 12 (5), 1-8, 2011	65	2011

Järjestelmä ei voi suorittaa toimenpidettä nyt. Yritä myöhemmin uudelleen.

Artikkelit 1–20

Sitaatteja vuodessa

Päällekkäiset lähteet

Yhdistetyt sitaatit

Lisää muut kirjoittajatMuut kirjoittajat

Lähetä PDF

Seuraa tätä tekijää

Viittaukset

Muut kirjoittajat