Niko Välimäki

Viittaukset

	Kaikki	2018 lähtien
Sitaatit	3099	2002
h-indeksi	29	22
i10-indeksi	43	31

440

220

110

330

200720082009201020112012201320142015201620172018201920202021202220239 15 27 37 53 87 92 106 132 228 274 317 380 378 425 418 83

Yleisessä käytössä

Näytä kaikki

31 artikkelia

1 artikkeli

käytettävissä

ei käytettävissä

Perustuu rahoitusehtoihin

Muut kirjoittajat

Veli MäkinenProfessor of Computer Science, University of HelsinkiVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa helsinki.fi
Kimmo PalinCancer Researcher, Research Program in Cancer Research, Univeristy of HelsinkiVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa helsinki.fi
Jouni SirénUC Santa Cruz Genomics InstituteVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa ucsc.edu
Esa PitkänenInstitute for Molecular Medicine Finland (FIMM)Vahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa helsinki.fi
Gonzalo NavarroUniversity of ChileVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa dcc.uchile.cl
Outi KilpivaaraUniversity of Helsinki, Memorial Sloan-Kettering Cancer CenterVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa helsinki.fi
Jussi TaipaleUniversity of Cambridge, Department of BiochemistryVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa cam.ac.uk
Antti HonkelaProfessor, University of HelsinkiVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa helsinki.fi
Wolfgang GerlachNetAppVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa netapp.com
Leena SalmelaUniversity of HelsinkiVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa cs.helsinki.fi
John A LeesEMBL-EBIVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa ebi.ac.uk
Johannes FischerTU DortmundVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa cs.tu-dortmund.de
Sebastian ManethProfessor für Informatik, Universität BremenVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa uni-bremen.de
Susana LadraUniversity of A Coruña, Centro de investigación CITICVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa udc.es
Kim NguyenAssistant Professor of Computer Science, Université Paris-Sud, FranceVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa lri.fr
Diego ArroyueloDepartamento de Informática, Universidad Técnica Federico Santa MaríaVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa inf.utfsm.cl
Sohan SethSenior Data Scientist, University of EdinburghVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa inf.ed.ac.uk
Lu ChengDepartment of Computer Science, Aalto University, FinlandVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa aalto.fi
Moshe LewensteinProfessor of Computer Science, Bar-Ilan UniversityVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa cs.biu.ac.il
Travis GagieAssociate Professor at Dalhousie UniversityVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa dal.ca

Seuraa

Niko Välimäki

Postdoctoral researcher, University of Helsinki

Vahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa cs.helsinki.fi - Kotisivu

compressed data structures combinatorial algorithms for sequence analysis


Nimike Lajittele sitaattien mukaan Lajittele vuoden mukaan Lajittele otsikon mukaan	Viittaukset Viittaukset	Vuosi
CTCF/cohesin-binding sites are frequently mutated in cancer R Katainen, K Dave, E Pitkänen, K Palin, T Kivioja, N Välimäki, AE Gylfe, ... Nature genetics 47 (7), 818-821, 2015	403	2015
Indexing graphs for path queries with applications in genome research J Sirén, N Välimäki, V Mäkinen IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 11 (2 …, 2014	237	2014
Storage and retrieval of highly repetitive sequence collections V Mäkinen, G Navarro, J Sirén, N Välimäki Journal of Computational Biology 17 (3), 281-308, 2010	220	2010
The Glanville fritillary genome retains an ancient karyotype and reveals selective chromosomal fusions in Lepidoptera V Ahola, R Lehtonen, P Somervuo, L Salmela, P Koskinen, P Rastas, ... Nature communications 5 (1), 4737, 2014	208	2014
Sequence element enrichment analysis to determine the genetic basis of bacterial phenotypes JA Lees, M Vehkala, N Välimäki, SR Harris, C Chewapreecha, ... Nature communications 7 (1), 12797, 2016	184	2016
Combined analysis of variation in core, accessory and regulatory genome regions provides a super-resolution view into the evolution of bacterial populations A McNally, Y Oren, D Kelly, B Pascoe, S Dunn, T Sreecharan, M Vehkala, ... PLoS genetics 12 (9), e1006280, 2016	173	2016
Genomic signatures of human and animal disease in the zoonotic pathogen Streptococcus suis LA Weinert, RR Chaudhuri, J Wang, SE Peters, J Corander, T Jombart, ... Nature communications 6 (1), 6740, 2015	134	2015
Global and regional dissemination and evolution of Burkholderia pseudomallei C Chewapreecha, MTG Holden, M Vehkala, N Välimäki, Z Yang, ... Nature microbiology 2 (4), 1-8, 2017	128	2017
Fast scaffolding with small independent mixed integer programs L Salmela, V Mäkinen, N Välimäki, J Ylinen, E Ukkonen Bioinformatics 27 (23), 3259-3265, 2011	94	2011
Whole-genome sequencing of growth hormone (GH)-secreting pituitary adenomas N Välimäki, H Demir, E Pitkänen, E Kaasinen, A Karppinen, L Kivipelto, ... The Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism 100 (10), 3918-3927, 2015	92	2015
Space-efficient algorithms for document retrieval N Välimäki, V Mäkinen Combinatorial Pattern Matching: 18th Annual Symposium, CPM 2007, London …, 2007	90	2007
Run-length compressed indexes are superior for highly repetitive sequence collections J Sirén, N Välimäki, V Mäkinen, G Navarro String Processing and Information Retrieval: 15th International Symposium …, 2009	87	2009
Frequent L1 retrotranspositions originating from TTC28 in colorectal cancer E Pitkänen, T Cajuso, R Katainen, E Kaasinen, N Välimäki, K Palin, ... Oncotarget 5 (3), 853, 2014	63	2014
Exome-wide somatic mutation characterization of small bowel adenocarcinoma UA Hänninen, R Katainen, T Tanskanen, RM Plaketti, R Laine, ... PLoS genetics 14 (3), e1007200, 2018	61	2018
Storage and retrieval of individual genomes V Mäkinen, G Navarro, J Sirén, N Välimäki Research in Computational Molecular Biology: 13th Annual International …, 2009	61	2009
Genetic predisposition to uterine leiomyoma is determined by loci for genitourinary development and genome stability N Välimäki, H Kuisma, A Pasanen, O Heikinheimo, J Sjöberg, R Bützow, ... Elife 7, e37110, 2018	55	2018
Fast in-memory XPath search using compressed indexes D Arroyuelo, F Claude, S Maneth, V Maakinen, G Navarro, K Nguyên, ... Data Engineering (ICDE), 2010 IEEE 26th International Conference on, 417-428, 2010	55*	2010
Retrotransposon insertions can initiate colorectal cancer and are associated with poor survival T Cajuso, P Sulo, T Tanskanen, R Katainen, A Taira, UA Hänninen, ... Nature Communications 10 (1), 4022, 2019	45	2019
Genetic and epigenetic characteristics of inflammatory bowel Disease–Associated colorectal cancer K Rajamäki, A Taira, R Katainen, N Välimäki, A Kuosmanen, RM Plaketti, ... Gastroenterology 161 (2), 592-607, 2021	43	2021
Approximate All-Pairs Suﬃx/Preﬁx Overlaps N Valimaki, S Ladra, V Makinen Combinatorial Pattern Matching: 21st Annual Symposium, CPM 2010, New York …, 2010	39*	2010

Järjestelmä ei voi suorittaa toimenpidettä nyt. Yritä myöhemmin uudelleen.

Artikkelit 1–20

Sitaatteja vuodessa

Päällekkäiset lähteet

Yhdistetyt sitaatit

Lisää muut kirjoittajatMuut kirjoittajat

Seuraa

Viittaukset

Muut kirjoittajat